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CircRNA測序

CircRNACircular RNA),是一類不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 polyA)尾巴、并以共價鍵形成穩定閉合環狀結構的非編碼 RNA 分子。 CircRNA 廣泛存在于生物細胞中,對 miRNA 起重要的調控作用,進而調控基因表達。隨著高通量測序技術的發展, CircRNA 在多種真核生物體內被大量鑒定出來,利用高通量測序技術,對生物樣本中的CircRNA 進行鑒定、表達豐度檢測及結構分析,是 RNA 領域的研究熱點,推動更深入的基因表達研究。



方案設計

CircRNA 實驗設計思路為差異比較,常見的類型為實驗組與對照組(case VS control),進行兩兩比較;若考慮時空因素,如按照不同生長發育階段或者疾病發生發展整個過程進行比較,即進行多重比較分析,然后對差異的CircRNA 來源基因進行預測和富集分析。一組樣品建議至少 6 個生物學重復。




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